Все зависит от того, насколько длительной была езда с изношенным ведомым диском сцепления. Вполне возможно, что он успел повредить маховик. Но при этом скорее всего ощущалась бы вибрация на педали сцепления. А так возможно причина в часой коробке. Например, в подшипниках валов.