Судя по всему есть 3 варианта решения вопроса:
1. замена печки если гарантия или лень лезть
2. смазать, но судя по опыту не всегда получается надолго (кстати я думаю многие были бы рады фотоотчету по смазке злосчастных подшипников)
3. еще существует вероятность замены каких-то сопротивлений внутри печки, которым приходит я так понял со временем износ и лечится перепайкой, где-то на стороннем форуме skoda-club.ru даже есть фотоотчет
P.S. Данный свист в течении 3 лет преследует меня в крайние морозы, но вылечивается достаточно быстро кратковременным включением максимальной скорости