Пока не могу понять о каком именно звуке идет речь - по Вашему оисанию трудно его к чему-либо привязать.
Один из варианов - на подходе к замене ремень генератора или ГРМ. У меня тоже при остановке двигателя был звук, похожий на легкий скрежет, точнее даже не скрежет, а такой скрип. Но у меня уже требовали замены ремни генератора и ГРМ. Поменял 2 месяца назад, теперь двигатель останавливается без этого звука.
По-хорошему, нужно послушать, прежде чем ставить диагноз.